厚生年金保険料及び健康保険料の算出の基となる標準報酬月額ですが、決定すると思います
456月の報酬で通常より多いは一般企業では珍しくありません
確認書類は必要ですか？必要と書いているところもあったり、必ずしも必要ではないとあったりして「結局どうなかな」とわかりません；；「住民票を移す」と従業員のは言ってますが、良いかなぁと
①について年金なので、給与所得控除額ではなく、公的年金等控除額を控除します
厚生年金保険についてです
控除に関しては手当てを含みます
（公務員等ではなく、一般上場企業です
産前４２日・産後５６日の産休期間の健康保険・厚生年金保険料は免除になりませんので、会社が負担されていると思われます